21-asrda dahshatli virus insoniyatning ko'p qismini yo'q qildi va omon qolganlarni maxsus gumbaz bilan himoyalangan yagona shaharda izolyatsiya qilishga majbur qildi. Aynan o'sha erda sirli agent Eon Flux ishlaydi, uning sabablari tushunarsiz va asosiy maqsadi taniqli siyosiy arbobdir.
